ข้อเท็จจริงก็ คือ มีความเชื่อว่าในกองกระดูกนั้น ไม่มีกระดูกของมาเรียกับเจ้าชายอเล็กซิสรวมอยู่ด้วย จากการที่นักวิทยาศาสตร์ชาวรัสเซียทำการพิสูจน์โดยการนำกระดูกที่พบ มาทำภาพเชิงซ้อน จึงเชื่อว่า ทั้งสองพระองค์น่าจะรอดชีวิตจากการสังหารหมู่ครั้งนั้น

ถึงกระนั้นก็ยังมีข้อถกเถียงกันในบางประเด็น โดยเฉพาะในเรื่องการต้องดำเนินการพิสูจน์ดีเอ็นเอ

แต่หลังจากนั้น นักวิทยาศาสตร์ชาวอเมริกัน ทำการตรวจสอบฟัน กระดูกสันหลัง และเศษชิ้นส่วนกระดูกที่เหลืออย่างละเอียดก่อนจะประกาศออกมาว่า ไม่พบเศษชิ้นส่วนกระดูกของเจ้าหญิงอนาสตาเซียกับเจ้าชายอเล็กซิส

เรื่องราวความลึกลับของเจ้ากญิงอนาสตาเชียยังคงเป็นปริศนาเรื่อยมา และมีการนำไปสร้างเป็นภาพยนตร์และการ์ตูนมากมาย หลังจากที่มีการขุดกระดูกราชวงศ์โรมานอฟขึ้นมาทำการตรวจสอบใหม่ ในเดือนมิถุนายน คศ. 1991 กระดูกเหล่านั้นยังอยู่ในห้องแล็บอีกหลายปี

จนกระทั่งชาวรัสเซียเรียกร้องให้นำไปฝังให้ถูกต้องตามประเพณี จึงมีการเลือกกันว่า จะนำไปฝังที่ไหนดี ระหว่างเมืองเอกาเติร์นบูร์ก กับนครเซ็นตืปีเตอร์สเบิร์ก ชาวรัสเซียทั้งหมดเห็นพ้องต้องกันว่า นครเซ็นต์ปีเตอร์เป็นที่ๆเหมาะสมที่สุดที่จะฝังร่างราชวงศ์โรมานอฟทุกพระองค์ได้ตราบนานเท่านาน

ดังที่ได้กล่าวมาแล้วว่าทุกพระองค์สิ้นพระชนม์หมด แต่หลังเหตุการณ์สังหารหมู่มาได้ 10 ปี ก็ปรากฏผู้หญิงคนหนึ่ง ชื่อ นางแอนนา แอนเดอร์สัน ได้ออกมาแสดงตว ระบุว่านาง คือ แกรนด์ ดัชเชส อนาสตาเซีย

โดยเล่าว่า ในวันที่ทุกพระองค์ในราชวงศ์ถูกปลงพระชนม์นั้น นางแอนนา (อนาสตาเซีย) ถูกยิง แต่เนื่องจากไม่ถูกจุดที่สำคัญ จึงรอดชีวิตมาได้ โดยมีนายทหารสองพี่น้องสกุลไซคอฟสกี้ให้ความช่วยเหลือ พาหลบหนีออกมายังประเทศโรมาเนีย ในเรื่องดังกล่าว พระเจ้าวรวงศ์เธอพระองค์เจ้าวิภาวดีรังสิต ทรงวิจารณ์เอาไว้อย่างน่าฟังว่า

"หญิงที่อ้างตัวว่าเป็น เจ้าหญิงอนาสตาเซียนั้น จะเป็นความจริงหรือไม่ ก็ไม่มีใครรู้ แต่ยังคงเป็นประเด็นถกเถียงกันเรื่อยมา มีผู้นำไปเขียนลงหนังสือกันก็เยอะ จริงบ้าง ไม่จริงบ้าง มีทั้งที่เอาไปทำเป็นหนัง เป็นละครออกมาฉายให้ผู้คนดูกันทั่วโลก ก็ทำมาแล้ว แต่ก็ยังไม่มีข้อสรุปว่าเป็นเรื่องจริงหรือไม่"

กระทั่งวันที่ 11 กุมภาพันธ์ คศ. 1957 หนังสือพิมพ์ในอเมริกาประโคมข่าวว่า นักมนุษยวิทยาผู้มีชื่อเสียงชาวเยอรมัน 4 คน ได้ทำการพิสูจน์และสรุปออกมาว่า นางแอนนา แอนเดอร์สัน ผู้อ้างตัวเป็นแกรนด์ ดัชเชส อนาสตาเซียนั้นไม่ใช่ตัวจริง!!

เนื่องจากทีมมนุษยวิทยากล่าวว่า หลังจากที่ได้ทำการศึกษาเปรียบเที่ยบรุปทรงใบหู จมูก และโหนกแก้ม กับรูปถ่ายเก่าๆ ของแกรนด์ ดัชเชส อนาสตาเซียที่มีอยู่แล้ว สามารถยืนยันได้เลยว่า นางแอนนา แอนเดอร์สัน เป็นคนละคนกับเจ้าหญิงอนาสตาเซียแน่นอน อีกทั้งตัวนางแอนนา แอนเดอร์สันเอง ก็ไม่มีหลักฐานที่มีน้ำหนักมายืนยันนอกเหนือจากคำพูด

ด้วยเหตุนี้ ศาลในกรุงเบอร์ลินตะวันตก จึงตัดสินว่านางแอนนา แอนเดอร์สัน เป็น แกรนด์ ดัชเชส อนาสตาเซียตัวปลอม ไม่มีสิทธิที่จะครอบครองเงิน 20 ล้านรูเบิลส์ ซึ่งพระเจ้า ซาร์นิโคลัสที่ 2 ทรงฝากไว้ในทนาคารที่ประเทศอังกฤษ ก่อนที่จะเกิดการปฏิวัติโดยกลุ่มบอลเชวิค

แต่ถึงหลักฐานทางวิชาการจะระบุออกมาเช่นนี้ ก็ยังมีผู้ที่เชื่อว่า นางแอนนา แอนเดอร์สัน คือ เจ้าหญิงอนาสตาเซีย อยู่เป็นจำนวนไม่น้อย

พิธีอัญเชิญพระศพมาไว้ที่ ป้อมปีเตอร์แอนด์ปอล นครเซ็นต์ปีเตอร์สเบิร์ก

แต่รูปอื่นนอกจากนี้เหมือนกันเด๊ะ ระหว่างแอนนากับเจ้าหญิง

พระญาติแบ่งเป็น 2 ฝ่ายครับ เชื่อและไม่เชื่อ // ไปๆ มาๆ ฝ่ายที่ไม่เชื่อชนะ เพราะว่ากลัวว่า แอนนา จะได้สมบัติของซารืนิโคลัสทั้งหมด เชืว่ามีการณ์ปลอมแปลง ติดสนบนทุกอย่าง เพื่อไม่ให้เป็นตัวจริงครับ ว่าไปแล้ว คิดว่ารอดยากนะครับ คืนสังหาร ปืนหลายกระบอกหลายนัด ความบ้าคลั่ง.... หลายมุมมองครับ